疏水层析填料：疏水层析是依据蛋白质疏水性差异分离的，即根据蛋白质和疏水介质表面的疏水基团的可逆相互作用进行分离。疏水力在高离子强度下被增强，因此在高离子强度环境中结合，通常釆用降低离子强度的方式进行洗脱。吸附分离模式使得疏水层析成为硫酸镣盐析后或离子交换高盐洗脱后理想的纯化方式。

亲和层析填料：亲和层析是基于生物分子与其他配基分子之间(如抗原与抗体、酶与底物、激素与受体、核酸中的互补链、多糖与蛋白复合体等)的特异性吸附原理建立和发展起来的。通过介质上的配基与目标分子之间的特异性吸附来实现纯化目标分子的目的。由于这种特异性的作用力，亲和层析具有高度选择性、高活性回收等特点。

复合模式层析填料：1.MMA配基是一种多模式配基，它与目标分子存在许多类型的相互作用，主要是离子作用（强阴离子作用），其次是氢键作用和疏水作用等。

离子交换层析填料：离子交换层析是目前蛋白质分离纯化中应用广泛的方法之一，不同蛋白等电点差异,分子大小差异，在同一个流动相中电荷密度分布不同，电荷量不等，与具有相反电荷的离子交换介质结合强度不同，在流动相洗脱时保留时间不同, 从而得以分离。

凝胶过滤层析填料​： 凝胶过滤层析也称为体积排阻层析、分子筛层析，是依据目标分子尺寸大小，由大到小按顺序出峰,从而达到分离目的。